Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX7

TRMT61A, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase catalytic subunit TRMT61A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61AQ96FX7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRMT61AQ96FX7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT61AQ96FX7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT61AQ96FX7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT61AQ96FX7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms