Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGF29Q96ES7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGF29Q96ES7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGF29Q96ES7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGF29Q96ES7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGF29Q96ES7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGF29Q96ES7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms