Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C18orf8Q96DM3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C18orf8Q96DM3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C18orf8Q96DM3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C18orf8Q96DM3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C18orf8Q96DM3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C18orf8Q96DM3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C18orf8Q96DM3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms