Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NXPE2Q96DL1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXPE2Q96DL1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NXPE2Q96DL1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXPE2Q96DL1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NXPE2Q96DL1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NXPE2Q96DL1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NXPE2Q96DL1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXPE2Q96DL1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXPE2Q96DL1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXPE2Q96DL1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXPE2Q96DL1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NXPE2Q96DL1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NXPE2Q96DL1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms