Protein–RNA interactions for Protein: Q96DH6

MSI2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2Q96DH6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI2Q96DH6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSI2Q96DH6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSI2Q96DH6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSI2Q96DH6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms