Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXorf40BQ96DE9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXorf40BQ96DE9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXorf40BQ96DE9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXorf40BQ96DE9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXorf40BQ96DE9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXorf40BQ96DE9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXorf40BQ96DE9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXorf40BQ96DE9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXorf40BQ96DE9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXorf40BQ96DE9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXorf40BQ96DE9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXorf40BQ96DE9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms