Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM3DQ96BQ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3DQ96BQ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3DQ96BQ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3DQ96BQ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3DQ96BQ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3DQ96BQ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3DQ96BQ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3DQ96BQ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3DQ96BQ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM3DQ96BQ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM3DQ96BQ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3DQ96BQ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3DQ96BQ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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