Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APH1AQ96BI3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APH1AQ96BI3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APH1AQ96BI3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APH1AQ96BI3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms