Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMIGD2Q96BF3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMIGD2Q96BF3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMIGD2Q96BF3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD2Q96BF3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMIGD2Q96BF3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMIGD2Q96BF3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms