Protein–RNA interactions for Protein: Q96A44

SPSB4, SPRY domain-containing SOCS box protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB4Q96A44 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPSB4Q96A44 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPSB4Q96A44 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPSB4Q96A44 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPSB4Q96A44 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPSB4Q96A44 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms