Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC47Q96A33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC47Q96A33 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC47Q96A33 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC47Q96A33 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC47Q96A33 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC47Q96A33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC47Q96A33 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC47Q96A33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC47Q96A33 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC47Q96A33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC47Q96A33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC47Q96A33 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC47Q96A33 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC47Q96A33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC47Q96A33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC47Q96A33 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC47Q96A33 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms