Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLP1Q92989 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLP1Q92989 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLP1Q92989 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLP1Q92989 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLP1Q92989 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLP1Q92989 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLP1Q92989 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLP1Q92989 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLP1Q92989 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLP1Q92989 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLP1Q92989 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLP1Q92989 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLP1Q92989 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLP1Q92989 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLP1Q92989 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLP1Q92989 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLP1Q92989 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLP1Q92989 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLP1Q92989 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLP1Q92989 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLP1Q92989 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CLP1Q92989 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLP1Q92989 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLP1Q92989 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLP1Q92989 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLP1Q92989 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLP1Q92989 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLP1Q92989 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLP1Q92989 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms