Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXTL1Q92935 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXTL1Q92935 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXTL1Q92935 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXTL1Q92935 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXTL1Q92935 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms