Protein–RNA interactions for Protein: Q92902

HPS1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1Q92902 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS1Q92902 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS1Q92902 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS1Q92902 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS1Q92902 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS1Q92902 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms