Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUBCNQ92622 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUBCNQ92622 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RUBCNQ92622 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUBCNQ92622 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUBCNQ92622 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUBCNQ92622 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUBCNQ92622 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUBCNQ92622 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUBCNQ92622 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUBCNQ92622 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUBCNQ92622 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUBCNQ92622 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUBCNQ92622 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUBCNQ92622 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUBCNQ92622 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUBCNQ92622 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms