Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DHX38Q92620 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DHX38Q92620 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX38Q92620 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX38Q92620 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX38Q92620 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX38Q92620 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DHX38Q92620 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DHX38Q92620 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DHX38Q92620 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DHX38Q92620 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DHX38Q92620 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DHX38Q92620 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
DHX38Q92620 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX38Q92620 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DHX38Q92620 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DHX38Q92620 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms