Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn16Q925N4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn16Q925N4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn16Q925N4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn16Q925N4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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