Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDB2Q92466 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB2Q92466 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDB2Q92466 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB2Q92466 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDB2Q92466 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDB2Q92466 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDB2Q92466 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDB2Q92466 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB2Q92466 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDB2Q92466 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDB2Q92466 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDB2Q92466 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDB2Q92466 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDB2Q92466 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDB2Q92466 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB2Q92466 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB2Q92466 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB2Q92466 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB2Q92466 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB2Q92466 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDB2Q92466 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDB2Q92466 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDB2Q92466 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB2Q92466 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDB2Q92466 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DDB2Q92466 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DDB2Q92466 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DDB2Q92466 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DDB2Q92466 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DDB2Q92466 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDB2Q92466 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB2Q92466 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB2Q92466 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB2Q92466 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDB2Q92466 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms