Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx18Q91ZR2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx18Q91ZR2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx18Q91ZR2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx18Q91ZR2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx18Q91ZR2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms