Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc1Q91Z38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc1Q91Z38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc1Q91Z38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc1Q91Z38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc1Q91Z38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc1Q91Z38 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc1Q91Z38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc1Q91Z38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttc1Q91Z38 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttc1Q91Z38 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc1Q91Z38 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc1Q91Z38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttc1Q91Z38 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttc1Q91Z38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttc1Q91Z38 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc1Q91Z38 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc1Q91Z38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttc1Q91Z38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttc1Q91Z38 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc1Q91Z38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc1Q91Z38 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc1Q91Z38 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc1Q91Z38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc1Q91Z38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc1Q91Z38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc1Q91Z38 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc1Q91Z38 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc1Q91Z38 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc1Q91Z38 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms