Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ3

Csdc2, Cold shock domain-containing protein C2, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csdc2Q91YQ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csdc2Q91YQ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csdc2Q91YQ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csdc2Q91YQ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csdc2Q91YQ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csdc2Q91YQ3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms