Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec16bQ91XT4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec16bQ91XT4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec16bQ91XT4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec16bQ91XT4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec16bQ91XT4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec16bQ91XT4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec16bQ91XT4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec16bQ91XT4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec16bQ91XT4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec16bQ91XT4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec16bQ91XT4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec16bQ91XT4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec16bQ91XT4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec16bQ91XT4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec16bQ91XT4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140 ms