Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vps36Q91XD6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps36Q91XD6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps36Q91XD6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps36Q91XD6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps36Q91XD6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps36Q91XD6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps36Q91XD6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps36Q91XD6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps36Q91XD6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps36Q91XD6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps36Q91XD6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps36Q91XD6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps36Q91XD6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps36Q91XD6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps36Q91XD6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps36Q91XD6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps36Q91XD6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps36Q91XD6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps36Q91XD6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps36Q91XD6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps36Q91XD6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps36Q91XD6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps36Q91XD6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps36Q91XD6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps36Q91XD6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps36Q91XD6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps36Q91XD6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps36Q91XD6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps36Q91XD6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps36Q91XD6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps36Q91XD6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps36Q91XD6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps36Q91XD6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps36Q91XD6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps36Q91XD6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms