Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan3Q91VW9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zkscan3Q91VW9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan3Q91VW9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan3Q91VW9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zkscan3Q91VW9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zkscan3Q91VW9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zkscan3Q91VW9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zkscan3Q91VW9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms