Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL1Q8WXF7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL1Q8WXF7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL1Q8WXF7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL1Q8WXF7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL1Q8WXF7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms