Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CKAP2Q8WWK9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CKAP2Q8WWK9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CKAP2Q8WWK9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKAP2Q8WWK9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKAP2Q8WWK9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKAP2Q8WWK9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 404.5 ms