Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APH1BQ8WW43 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APH1BQ8WW43 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APH1BQ8WW43 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APH1BQ8WW43 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APH1BQ8WW43 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APH1BQ8WW43 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
APH1BQ8WW43 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APH1BQ8WW43 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APH1BQ8WW43 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APH1BQ8WW43 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms