Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCTD4Q8WVF5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCTD4Q8WVF5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCTD4Q8WVF5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCTD4Q8WVF5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCTD4Q8WVF5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCTD4Q8WVF5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KCTD4Q8WVF5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCTD4Q8WVF5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCTD4Q8WVF5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCTD4Q8WVF5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCTD4Q8WVF5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD4Q8WVF5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD4Q8WVF5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCTD4Q8WVF5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms