Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC107Q8WV48 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC107Q8WV48 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC107Q8WV48 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC107Q8WV48 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC107Q8WV48 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC107Q8WV48 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms