Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCM7

Fgg, Fibrinogen gamma chain, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FggQ8VCM7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
FggQ8VCM7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FggQ8VCM7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FggQ8VCM7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FggQ8VCM7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FggQ8VCM7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FggQ8VCM7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FggQ8VCM7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms