Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn4Q8VCH8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn4Q8VCH8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn4Q8VCH8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubxn4Q8VCH8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubxn4Q8VCH8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubxn4Q8VCH8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn4Q8VCH8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn4Q8VCH8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn4Q8VCH8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn4Q8VCH8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn4Q8VCH8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ubxn4Q8VCH8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn4Q8VCH8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn4Q8VCH8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubxn4Q8VCH8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn4Q8VCH8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn4Q8VCH8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn4Q8VCH8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn4Q8VCH8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn4Q8VCH8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubxn4Q8VCH8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms