Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm4cQ8VCD7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm4cQ8VCD7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm4cQ8VCD7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm4cQ8VCD7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm4cQ8VCD7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm4cQ8VCD7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm4cQ8VCD7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm4cQ8VCD7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm4cQ8VCD7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm4cQ8VCD7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm4cQ8VCD7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm4cQ8VCD7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm4cQ8VCD7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kdm4cQ8VCD7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm4cQ8VCD7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm4cQ8VCD7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm4cQ8VCD7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm4cQ8VCD7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm4cQ8VCD7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm4cQ8VCD7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kdm4cQ8VCD7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm4cQ8VCD7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm4cQ8VCD7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm4cQ8VCD7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm4cQ8VCD7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm4cQ8VCD7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm4cQ8VCD7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4cQ8VCD7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4cQ8VCD7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4cQ8VCD7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4cQ8VCD7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm4cQ8VCD7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm4cQ8VCD7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm4cQ8VCD7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm4cQ8VCD7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm4cQ8VCD7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kdm4cQ8VCD7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Kdm4cQ8VCD7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm4cQ8VCD7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm4cQ8VCD7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms