Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIPC3Q8TF64 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIPC3Q8TF64 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC3Q8TF64 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC3Q8TF64 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GIPC3Q8TF64 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GIPC3Q8TF64 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GIPC3Q8TF64 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC3Q8TF64 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GIPC3Q8TF64 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GIPC3Q8TF64 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GIPC3Q8TF64 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIPC3Q8TF64 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIPC3Q8TF64 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIPC3Q8TF64 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms