Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEW8

PARD3B, Partitioning defective 3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD3BQ8TEW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARD3BQ8TEW8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PARD3BQ8TEW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARD3BQ8TEW8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARD3BQ8TEW8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PARD3BQ8TEW8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARD3BQ8TEW8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARD3BQ8TEW8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PARD3BQ8TEW8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PARD3BQ8TEW8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARD3BQ8TEW8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARD3BQ8TEW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PARD3BQ8TEW8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARD3BQ8TEW8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PARD3BQ8TEW8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARD3BQ8TEW8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARD3BQ8TEW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms