Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX29Q8TEQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX29Q8TEQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SNX29Q8TEQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX29Q8TEQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX29Q8TEQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX29Q8TEQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1141.6 ms