Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTRT2Q8TDY3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTRT2Q8TDY3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTRT2Q8TDY3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTRT2Q8TDY3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTRT2Q8TDY3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTRT2Q8TDY3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTRT2Q8TDY3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTRT2Q8TDY3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTRT2Q8TDY3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACTRT2Q8TDY3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTRT2Q8TDY3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTRT2Q8TDY3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTRT2Q8TDY3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTRT2Q8TDY3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms