Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HELQQ8TDG4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HELQQ8TDG4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HELQQ8TDG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HELQQ8TDG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HELQQ8TDG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HELQQ8TDG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms