Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RAB3IL1Q8TBN0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3IL1Q8TBN0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3IL1Q8TBN0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3IL1Q8TBN0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3IL1Q8TBN0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3IL1Q8TBN0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3IL1Q8TBN0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3IL1Q8TBN0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3IL1Q8TBN0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB3IL1Q8TBN0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3IL1Q8TBN0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3IL1Q8TBN0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3IL1Q8TBN0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3IL1Q8TBN0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3IL1Q8TBN0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3IL1Q8TBN0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3IL1Q8TBN0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3IL1Q8TBN0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3IL1Q8TBN0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3IL1Q8TBN0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3IL1Q8TBN0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3IL1Q8TBN0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB3IL1Q8TBN0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3IL1Q8TBN0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms