Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf43Q8TAL5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C9orf43Q8TAL5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C9orf43Q8TAL5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf43Q8TAL5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf43Q8TAL5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms