Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATL2Q8NHH9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATL2Q8NHH9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATL2Q8NHH9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATL2Q8NHH9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATL2Q8NHH9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATL2Q8NHH9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATL2Q8NHH9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms