Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFQ6

BPIFC, BPI fold-containing family C protein, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFCQ8NFQ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFCQ8NFQ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFCQ8NFQ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BPIFCQ8NFQ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFCQ8NFQ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BPIFCQ8NFQ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFCQ8NFQ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFCQ8NFQ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BPIFCQ8NFQ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFCQ8NFQ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPIFCQ8NFQ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFCQ8NFQ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPIFCQ8NFQ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFCQ8NFQ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPIFCQ8NFQ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPIFCQ8NFQ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms