Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ9

BBS1, Bardet-Biedl syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1Q8NFJ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS1Q8NFJ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS1Q8NFJ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS1Q8NFJ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBS1Q8NFJ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS1Q8NFJ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS1Q8NFJ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS1Q8NFJ9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS1Q8NFJ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS1Q8NFJ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS1Q8NFJ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBS1Q8NFJ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBS1Q8NFJ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms