Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP3

DNAAF1, Dynein assembly factor 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF1Q8NEP3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAAF1Q8NEP3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF1Q8NEP3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAAF1Q8NEP3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF1Q8NEP3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF1Q8NEP3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAAF1Q8NEP3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms