Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CATSPER1Q8NEC5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CATSPER1Q8NEC5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CATSPER1Q8NEC5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CATSPER1Q8NEC5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CATSPER1Q8NEC5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CATSPER1Q8NEC5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms