Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE23Q8NDY6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE23Q8NDY6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE23Q8NDY6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE23Q8NDY6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE23Q8NDY6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms