Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDF8

PAPD5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD5Q8NDF8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAPD5Q8NDF8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PAPD5Q8NDF8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAPD5Q8NDF8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPD5Q8NDF8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPD5Q8NDF8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPD5Q8NDF8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms