Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC197Q8NCU1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC197Q8NCU1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC197Q8NCU1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC197Q8NCU1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC197Q8NCU1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC197Q8NCU1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC197Q8NCU1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms