Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC54

KCT2, Keratinocyte-associated transmembrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCT2Q8NC54 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCT2Q8NC54 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCT2Q8NC54 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCT2Q8NC54 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCT2Q8NC54 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCT2Q8NC54 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCT2Q8NC54 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms