Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC01

CLEC1A, C-type lectin domain family 1 member A, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1AQ8NC01 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC1AQ8NC01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLEC1AQ8NC01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC1AQ8NC01 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC1AQ8NC01 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLEC1AQ8NC01 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLEC1AQ8NC01 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms