Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP11CQ8NB49 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP11CQ8NB49 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP11CQ8NB49 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11CQ8NB49 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP11CQ8NB49 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP11CQ8NB49 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP11CQ8NB49 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP11CQ8NB49 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP11CQ8NB49 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP11CQ8NB49 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP11CQ8NB49 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP11CQ8NB49 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP11CQ8NB49 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP11CQ8NB49 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP11CQ8NB49 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP11CQ8NB49 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP11CQ8NB49 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP11CQ8NB49 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP11CQ8NB49 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP11CQ8NB49 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms